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<a href="/ruta/al/contenido1.php">enlace 1</a>
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<a href="/ruta/al/contenido3.php">enlace 3</a>
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<a href="/ruta/al/contenido3.php">enlace 4</a>
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<a href="/ruta/al/contenido4.php">enlace 5</a>
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// Code goes here
$(document).ready(function(){
$('a').each(function(){
//cambio la parte de la ruta que me interesa
$(this).attr('href', $(this).attr('href').replace('/ruta/','/ruta-app/') );
});
});